Les différences entre clade, taxon et groupe monophylétique

Diverses sources suggèrent qu'il existe au moins 8,7 millions d'espèces d'êtres vivants sur la planète. De tous, on estime que 86% des terrestres et 91% des marins restent à découvrir. À ce jour, nous ne connaissons que 1,3 million d'êtres vivants, nous avons donc encore un long chemin à parcourir.

Les êtres humains ont besoin d'outils pour compartimenter l'énorme quantité d'informations que nous recueillons et les variété physiologique qui nous entoure, et la phylogénétique est une discipline de la biologie qui nous aide à le faire dans le domaine de êtres vivants.

Malheureusement, nous avons affaire à un outil complexe à appréhender et, par conséquent, il est normal que le citoyen moyen se perde dans des termes comme "clade", "taxon", "groupe monophylétique" et bien d'autres mots aux connotations complexes. C'est pourquoi nous sommes ici, car nous verrons quelles sont les différences entre ces termes.

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L'importance de la phylogénie

Nous ne pouvons décrire ces termes sans faire d'abord mention spéciale de la phylogénie et de la phylogénétique. La phylogénie est définie comme les relations de parenté entre les espèces et, quant à elle, La phylogénétique est la discipline de la biologie chargée de les découvrir..

En d'autres temps, ces relations phylogénétiques étaient déduites de caractères morphologiques et dans une moindre mesure mesure anatomique et chimique, car il n'y avait pas d'autre moyen de relier les êtres vivants au-delà des modèles observables. Aujourd'hui et après la découverte de la PCR (Polymerase Chain Reaction), des relations beaucoup plus fiables peuvent être établies.

En général, on peut résumer le processus dans les étapes suivantes: le tissu d'un être vivant est extrait et son ADN est isolé, qu'il soit nucléaire, plastidial (chez les plantes) ou mitochondrial, il est amplifié puis séquence. Cette séquence d'ADN est comparée à celles de ses éventuels parents et, par l'analyse des homologies génétiques (c'est-à-dire des séquences similaires pour la même origine évolutive) une série d'arbres phylogénétiques sont générés avec des programmes informatiques.

Ce type de diagramme présente les relations évolutives entre les groupes d'êtres vivants qui analyser, en prenant l'ancêtre commun comme base ou tronc et les différentes espèces comme suite ramifications. Il convient de noter que, dans de nombreux cas, ces arbres ne sont pas totalement fiables et qu'il n'y a pas d'option unique à prendre comme dogme. Nous sommes confrontés à une série d'hypothèses plus ou moins probables, mais dans très peu de cas sont des faits définitifs.

Différences entre clade, taxon et groupe monophylétique

Cette introduction était nécessaire, car il est impossible de comprendre les termes qui nous concernent aujourd'hui sans passer beaucoup de temps à comprendre ce qu'est un arbre phylogénétique et comment il se construit. Une fois que nous avons ouvert la voie, nous présentons chacun des termes séparément, puis discutons des principales différences entre eux.

1. clade

Un clade fait référence en biologie à groupe d'êtres vivants formé par un rameau phylogénétique composé d'une espèce et de tous ses descendants.

Si nous faisons une seule "coupe" dans un arbre phylogénétique de manière ancrée, nous inclurons l'ancêtre commun (à la base) et tous ses descendants dans les branches suivantes. Toutes ces espèces englobées à la suite de l'ancêtre commun forment une seule branche sur l'arbre de vie.

2. taxon

Les choses se compliquent, car on a affaire à des mots qui peuvent sembler assez similaires à première vue. Pour sa part, un taxon est défini comme un groupe d'organismes apparentés qui, dans une classification donnés ont été regroupés dans une hiérarchie d'inclusion, où chaque niveau englobe d'autres niveaux mineurs (en général). Les catégories taxonomiques fondamentales sont, du plus haut au plus bas: domaine, royaume, phylum, classe, ordre, famille, genre et espèce.. Donnons un exemple :

Être humain: Domaine Eukaryota- Royaume Animalia- Phylum Chordata- Classe Mammalia- Ordre Primates- Famille Hominidae- Genre Homo- espèce Homo sapiens.

Ainsi, cette classification taxonomique nous définit complètement en tant qu'espèce. Nous sommes des êtres eucaryotes car nous sommes constitués de cellules avec un vrai noyau, nous sommes aussi des animaux chordés, puisque nous présentons un embryon avec des caractéristiques communes à d'autres animaux et que nous sommes aussi des primates hominidés.

La clé d'un taxon, contrairement à un clade, est qu'il peut ou non être naturel.. Un taxon naturel suit les directives d'un clade, puisqu'il ne représente que les êtres vivants qui se trouvent dans une branche de l'arbre phylogénétique de la vie, c'est-à-dire qu'ils proviennent d'un ancêtre commun et présentent des relations évolutives clair.

D'autre part, un taxon artificiel est un taxon qui n'existe pas dans la nature, c'est-à-dire qui les individus répertoriés dans un tel taxon n'ont pas besoin d'avoir un ancêtre commun. Un exemple en est les protozoaires, qui ont des caractéristiques similaires mais qui ont des ancêtres très éloignés les uns des autres. C'est une convention linguistique qui permet de regrouper les êtres vivants dans une sorte de « sac mélangé » pour mieux se comprendre.

Ainsi, les fleurs qui présentent la couleur de leurs pétales jaunes peuvent former leur propre taxon, ou les animaux aquatiques peuvent être séparés des terrestres au moyen d'un groupement taxonomique artificiel. Ces êtres vivants n'ont peut-être pas d'ancêtres communs, mais ils se regroupent pour comprendre une série de caractéristiques particulières ou un mode de vie commun.

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3. groupe monophylétique

Un groupe d'êtres vivants est monophylétique si tous les organismes qui le composent ont évolué à partir d'une seule population ou espèce ancestrale. et tous les descendants font partie de ce groupe. Il faut le différencier de deux autres termes qui l'accompagnent habituellement :

Groupe paraphylétique: comprend l'ancêtre commun de tous les membres, mais pas tous ses descendants. Groupe polyphylétique: n'inclut pas l'ancêtre commun le plus récent des groupes. Il est constitué par une sélection artificielle de branches de l'arbre évolutif.

Il n'y a pas de demi-mesure ici: clade et groupe monophylétique sont synonymes. De même, un groupe paraphylétique est un clade auquel un groupe a été soustrait à des fins explicatives ou scientifiques. Par exemple, les reptiles sont un groupe paraphylétique, puisque les oiseaux sont exclus, avec lesquels ils partagent un ancêtre commun. Ne ressemblant pas au reste des animaux de ce groupe, il a été décidé de créer une scission artificielle qui ne répond pas à la fidélité de l'arbre évolutif. Pour lui, le groupe de reptiles manque de validité taxonomique d'un point de vue strict.

D'autre part, et en construisant plus de ponts, un groupe polyphylétique pourrait aussi être considéré comme un taxon artificiel. En utilisant le même exemple que précédemment, les protozoaires sont sélectionnés à partir de différentes branches de l'arbre évolutif sans ont des ancêtres communs directs, en raison des caractéristiques et des modes de vie communs qu'ils présentent entre eux ils.

Alors: qu'est-ce qui les différencie ?

Si vous êtes venu chercher des écarts, vous risquez d'être déçu. Un clade, un taxon naturel complet et un groupe monophylétique en viennent à exprimer la même chose: un ancêtre commun et tous ses descendants.

D'autre part, nous insistons sur le terme "taxon naturel complet". Un taxon ne doit pas toujours correspondre à un clade car, comme nous l'avons vu, il y a des chercheurs dans le monde de la taxonomie qui ont des raisons de proposer et utiliser des groupes paraphylétiques plus intuitifs que les groupes monophylétiques réels qui les englobent, générant ainsi des classifications plus utiles et prédictif. C'est aussi le cas des taxons artificiels (groupes polyphylétiques), parmi lesquels on retrouve les groupes d'algues ou de protozoaires déjà nommés.

résumé

Vous pouvez avoir mal à la tête à cause de toute la terminologie et des concepts alambiqués, mais le message général est simple: un clade et un groupe monophylétique peuvent être considérés comme synonymes, alors qu'un taxon ne doit pas toujours correspondre au clade, puisque parfois des modifications sont apportées afin de générer des regroupements plus intuitifs et faciles à comprendre.

C'est le cas des reptiles déjà nommés, par exemple. Au lieu de séparer les reptiles et les oiseaux en deux groupes différents, la chose la plus correcte à faire serait de parler du clade sauropsida (reptiles + oiseaux modernes), puisqu'il s'agit d'un groupe monophylétique avec un ancêtre commun. Les oiseaux sont-ils donc des reptiles? Non. Les deux sont des sauropsides, certains volent et d'autres non.

Références bibliographiques:

• Ils calculent le nombre d'espèces sur la planète à 8,7 millions, BBC News. Récolté le 8 novembre à https://www.bbc.com/mundo/noticias/2011/08/110824_especies_censo_am
• Clade, étymologies de piment. Récolté le 8 novembre à http://etimologias.dechile.net/?clado
• Phylogenies, sesbe.org. Récolté le 8 novembre à https://www.sesbe.org/evosite/evo101/IIBPhylogeniesp2.shtml.html#:~:text=Un%20clado%20es%20una%20agrupaci%C3%B3n, vous avez%20élagué%20form%20a%20clade.
• Si les oiseaux sont des dinosaures, alors les oiseaux sont-ils des reptiles? Et pourquoi du point de vue des classifications linnéenne et cladistique? Quora Magazine. Récolté le 8 novembre à https://es.quora.com/Si-los-p%C3%A1jaros-son-dinosaurios-entonces-las-aves-son-reptiles-Y-por-qu%C3%A9-desde-los-puntos-de-vista-de-las-clasificaciones-Linneana-y-Clad%C3%ADstica#:~:text=%C2%BFLas%20aves%20son%20reptiles%3F, système%20taxon%C3%B3myco%20of%20Carlos%20Linn%C3%A9.
• Taxon, EcuRed. Récolté le 8 novembre à https://www.ecured.cu/Tax%C3%B3n
• THÈME 1. QU'EST-CE QU'UNE PHYLOGENIE MOLECULAIRE ET A QUOI SERVE-T-ELLE?, Manuel d'analyse phylogénétique moléculaire. Récolté le 8 novembre à https://formacion.uam.es/pluginfile.php/122717/mod_resource/content/2/1_W_Tema_1.pdf